Ihmiset kayttavat melatoniinia saataa kehon sisaisen kellon. Sita kaytetaan jet lag, saatamalla uni-vanavedessa jaksoissa ihmisia, joiden paivittainen tyo aikataulu muutokset (shift work disorder), ja auttaa sokeita ihmiset perustavat paivan ja yon ajan. Melatoniinia kaytetaan myos kyvyttomyys nukahtaa (unettomuus); viivastynyt unijakso oireyhtyma (DSP); rapid eye movement-unen kayttaytymisen hairio (RBD); unettomuus liittyy huomiota alijaaman yliaktiivisuus yleistilan hairiosta (ADHD); unettomuus johtuu tietyista korkea verenpaine laakkeita kutsutaan beeta-salpaajat; ja nukkua ongelmia lasten kanssa kehitykselliset hairiot kuten autismi, cp-vamma ja kehitysvamma. Sita kaytetaan myos nukkua tuki lopettamisen jalkeen kayttaa bentsodiatsepiini huumeet ja vahentaa haittavaikutuksia tupakoinnin lopettaminen. Jotkut ihmiset kayttavat melatoniinia Alzheimerin tauti tai muistin heikkeneminen (dementia), kaksisuuntainen mielialahairio, keuhkosairaus nimelta pitkaaikainen ahtauttava keuhkosairaus (COPD), unettomuus aiheuttama beeta-salpaaja laakkeita, endometrioosi, korvien soiminen, masennus tai vuodenaikojen mielialahairio (SAD), lieva vajaatoiminta, alkoholittomat maksasairaus, krooninen vasymysoireyhtyma (CFS), fibromyalgia, levottomat jalat-oireyhtyma, tulehduksellinen sairaus nimelta sarkoidoosi, skitsofrenia, migreeni ja muut paansaryt, ikaantymiseen liittyva naon menetys, hyvanlaatuinen eturauhasen liikakasvu (BPH)artyvan suolen oireyhtyma (IBS), luukato (osteoporoosi), liikkeen sairaus nimelta tardiivi dyskinesia (TD), happamat royhtaykset tauti, Helicobacter pylori (H. pylori), liikunta suorituskykya, lapsettomuus, epilepsia, ikaantyminen, vaihdevuodet, metabolinen oireyhtyma, hyodynnettavaksi leikkauksen jalkeen, levottomuus aiheuttama anestesian, stressi, tahattomat liikkeet hairio (tardiivi dyskinesia), muutokset sydamen syke, kun siirrytaan yleisista istuu ylos (posturaalinen takykardia oireyhtyma), delirium, kyvyttomyys hallita virtsaaminen, leuka kipu, tulehduksellinen suolistosairaus (haavainen koliitti), ja syntyvyyden.